见月大师等人本来还想狡辩或者直接诬赖秦泰的，可是看见走进来的几个人之后，他们一个个像斗败的公鸡一样。进来的人有徐家大少爷和英国公的老管家等人，他们可以证明张月娥的身份。出云公主家的管家和亲信手下，他们可以证明出云公主不但让他们暗中联络皇亲国戚，而且让他们私下散布过不利于小皇帝一家人的言论。几个僧人打扮的人，见月大师一看就明白了，他们都是见月大师最亲新的手下和见月大师一样以前都是倭寇。他们被抓不了，被押送到了皇宫，就代表见月大师的一切都已经暴露了。
随着这些人进来的还有一个年过半百的中年和尚，他就是北少林总院的戒律院首座，也就是这次围剿永安寺的总指挥。戒律院首座大师首先给小皇帝恭恭敬敬行礼，然后讲述了围剿永安寺倭寇的全过程。大概在十七天之前，北少林来了一个朝廷锦衣卫的百户，他送来了一封秦泰的亲笔信。当时接待这个锦衣卫百户的是北少林知客僧，看了这封没有封口的信件后，知客僧脸色大变。不久之后北少林有地位的几个大德全部秘密集合，每一个人都亲眼看了这封信，信里的内容令大家十分震惊。秦泰用极为简单的词句说明了三个要说的内容。第一，南少林永安寺出现了问题，可能有不少不应该有的武器和装备。第二，永安寺中可能有为数不少的倭寇武僧。第三，永安寺方丈见月大师等人可能参与或者是策划了对朝廷和皇室不利的行为。
北少林高层虽然不愿意相信秦泰的话，但是他们也深知秦泰不是一个说谎的人。戒律院首座大师为首的几个人建议宁可信其有不可信其无，为了少林寺的名誉，为了众多僧人的安全，绝对不能让这种可能存在。北少林高层决定派出戒律院首座大师为首的调查团前往永安寺调查。为了保密，为了安全，为了能够查出事实，戒律院首座大师不但决定秘密前往，而且找好了一个借口，说是普查少林寺下院的经济账目。
锦衣卫百户临走的时候提醒戒律院首座大师等人，永安寺不但有倭寇存在，而且有大量制式武器，要是他们准备不充分的话，可能会适得其反。戒律院首座大师考虑再三后，决定让北少林戒律院武僧除了留守人员之外全部出动。有的化妆成随行，有的化妆成护送检查团的武僧，有的直接化装成检查团的成员，更有的武僧分批化装成老百姓靠近永安寺。
戒律院首座带着人来到永安寺，永安寺的人一边客气接待大家，一边以方丈大师不再永安寺为理由故意拖延大家。戒律院首座大师把带来的人分为三批，第一批按照原定计划清查永安寺的经济账目。第二批以调查永安寺僧人目数和来历为理由，核对僧人数量和来历。第三批以清查永安寺庙产为理由走访永安寺周边。秘密前来的武僧直接赶往永安寺后山山谷。
早在永安寺等候大家的秦泰舅舅仇民，带领秘密武僧来到山谷。当大家看见这么多制式武器和金银的时候，大家傻眼了也惊呆了。戒律院首座大弟子也是这批秘密武僧的带头人看着带着黑血的金银珠宝，看见几把依旧锋利的倭刀，整个人冒出了不该有的杀气。事后才知道这个戒律院首座大弟子就是福|建人，一家人都死在倭寇手里，他是被戚家军从死人堆里挖出来的，如今他身上还有两处倭寇留下的伤疤。永安寺不但成为了倭寇的避难所，而且将当年抢来的财物堂而皇之地留在山谷，这让戒律院首座大弟子很生气。
仇民一边尽量劝说戒律院首座大弟子克制自己的情绪，一边想出了一个如何却别倭寇武僧和普通武僧的办法。用山谷里面发现的金银，拿出一些没有标记的作为活动经费。仇民等人化装成香客上山礼佛，同时准备好一大批僧人专用的衣服袜子，说要亲手给每一位师傅洗脚换上新袜子。这个在当时虽然有点过头，但是也不是没有过，永安寺每年总能遇上这么一两个十分虔诚的信众。在给僧人洗脚的时候，通过观察确定对方是否是倭寇。凡是有可疑的僧人一律送上带标记的新袜子，戒律院首座但是带来的武僧将会秘密抓捕审讯。
就这样不到三天时间，抓捕和审讯供述引出的倭寇不下六十人。戒律院首座正式下达了封锁永安寺的命令，大批少林寺戒律院武僧控制了永安寺。把一般的僧人和无关的僧人集中看管起来，对于有问题的僧人下达了抓捕令，凡是反抗的武僧全部就地制服。在这个过程中戒律院首座大师还发现了不少僧人违反清规戒律的事情，戒律院首座觉得有必要对永安寺进行一次大规模的整顿了。
在清查中戒律院首座大师发现，永安寺最核心的武僧中十有七八是曾经的倭寇。这些看上去四五十岁的武僧，是永安寺武僧的中坚力量，可是他们却是曾经的敌人和仇人倭寇。在这些倭寇中有不少人手里有汉人和老百姓的鲜血，更有一些人曾经和朝廷的军队对战过。他们为了躲避朝廷的追捕躲在了永安寺，永安寺成为了他们的避难所。永安寺曾经是打击倭寇的一股不可缺少的力量，现在成为了倭寇的避难所，这是对永安寺的一种羞辱，更是一种对佛门的一种亵渎。这些倭寇不但心安理得地留在了永安寺，而且把他们的后代也安排进了永安寺。永安寺里面不但有这些老牌正牌的倭寇，还有二三十岁的倭寇第二代，这些倭寇的孩子也被安排进了永安寺，他们想长期霸占和控制永安寺。
一个倭寇第二代交代，永安寺的倭寇武僧不光这些，有的人安排出去完成任务，更有的人去了秘密基地。所谓秘密基地是倭寇在大明的另外一个重要基地，那里有更多的倭寇和倭寇后代。凡是倭寇武僧私下和妇女生的孩子，几乎全部被秘密送往了这个基地。等孩子渐渐长大后，有的被安排来了永安寺当假和尚，有的被安排去了一些军营当兵，更有的人安排去了其他地方秘密潜伏下来。
戒律院首座大师一边清理永安寺的残余势力，一边把审讯的结果上报给锦衣卫。锦衣卫以最快速度传递给小皇帝和秦泰，秦泰决定对秘密基地和几个军营进行彻底处理。英国公世子刚好到了领兵的年纪，英国公家族作为世代武将，每一个到了年纪的英国公后代都需要去军营锻炼一段时间。秦泰建议小皇帝让英国公世子把有可疑的军队带出去，名义上是去锻炼，实际上是调虎离山。得到确实证据后，调动其他部队包围或者控制这些军队，清除里面倭寇的残余势力。
至于秘密基地，秦泰觉得里面不可能有太多的武力，估计都是老弱妇孺。只需要清除外围掩护和防御力量，就可以彻底控制秘密基地，从而证实这个小镇是否真的是倭寇留下来的培养后代的地方。小皇帝同意了秦泰的建议，派出锦衣卫化装成运送货物的伙计，确定小镇的外围防御布置和里面的人是否真的有问题。探子果然发现了小镇的异样，第一，小镇外围真的有不少明暗岗哨，一般的老百姓不会这么做。第二，这些人不但手里有精良的武器，而且说话的声音有点古怪，不像是汉人。第三，通过检查进入小镇内部后，发现里面的人虽然汉人老百姓打扮，但是穿木屐，见到别人行的是日本人的鞠躬礼仪，时不时说出几句倭寇的语言。第四，小镇里面很少看见成年男子，一般都是老人和妇女，就连孩子也不多见。
小皇帝决定对小镇动手，锦衣卫探子带领一些精英混进去，解决外围的守卫。然后大部队冲进小镇，对里面的人进行身份核查和辨认。让大家没想到的事情发生了，外围的守卫不但懒散而且战斗力不强，可是大部队进入小镇之后，遇上了难以抵抗的阻击力量。看上去都已经五六十岁的老人，他们竟然拿起凡是可以使用的工具对抗军队。反而是一些年轻妇女，不但不出手反而躲了起来，更有的妇女要给军队的人带路。事后才知道这些敢于对抗军队的老人是第一代的倭寇或者倭寇家属，他们才是真正的倭寇本民族的人，三四十岁的妇女是他们作为倭寇时候抢来的女人，二三十岁的妇女基本都是大明的老百姓。只有那些真正的倭寇才会这么痛恨大明军队，才会拼死保护这个基地。